AT5G46360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ca2+ activated outward rectifying K+ channel 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes AtKCO3, a member of the Arabidopsis thaliana K+ channel family of AtTPK/KCO proteins. AtKCO3 is targeted to the vacuolar membrane. Forms homomeric ion channels in vivo. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Ca2+ activated outward rectifying K+ channel 3 (KCO3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Ion transport 2 (InterPro:IPR013099); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ca2+ activated outward rectifying K+ channel 2 (TAIR:AT5G46370.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:18806858..18808134 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29110.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 260 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPMTPSEFKN RLLFGSLPRS SSDPTDLQFT EPNVPPSLFS LPEHNDDTAT DMAPDQETEQ SVSKSIARQA LALLVVYLSL GVLIYWLTLD SDNAYQTHPV 101: AVALYFFVVT FCGFLIVHFV VKIGWLDSFC FSVMMVTTVG FGDRAFNTWL GTFLAAVWLL VSTLAVARAF LFLADARADK RNRERAKKVL GESISISQFF 201: AADIDNDGRL SLAEFAIYKL KQMEKITQED FIQICNQFDK LDRTQSGRIT LVDLTTATSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)