AT5G24900.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 714, subfamily A, polypeptide 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of CYP714A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 714, subfamily A, polypeptide 2 (CYP714A2); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 714, subfamily A, polypeptide 1 (TAIR:AT5G24910.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:8563853..8566771 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59337.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 525 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESLVVHTVN AIWCIVIVGI FSVGYHVYGR AVVEQWRMRR SLKLQGVKGP PPSIFNGNVS EMQRIQSEAK HCSGDNIISH DYSSSLFPHF DHWRKQYGRI 101: YTYSTGLKQH LYINHPEMVK ELSQTNTLNL GRITHITKRL NPILGNGIIT SNGPHWAHQR RIIAYEFTHD KIKGMVGLMV ESAMPMLNKW EEMVKRGGEM 201: GCDIRVDEDL KDVSADVIAK ACFGSSFSKG KAIFSMIRDL LTAITKRSVL FRFNGFTDMV FGSKKHGDVD IDALEMELES SIWETVKERE IECKDTHKKD 301: LMQLILEGAM RSCDGNLWDK SAYRRFVVDN CKSIYFAGHD STAVSVSWCL MLLALNPSWQ VKIRDEILSS CKNGIPDAES IPNLKTVTMV IQETMRLYPP 401: APIVGREASK DIRLGDLVVP KGVCIWTLIP ALHRDPEIWG PDANDFKPER FSEGISKACK YPQSYIPFGL GPRTCVGKNF GMMEVKVLVS LIVSKFSFTL 501: SPTYQHSPSH KLLVEPQHGV VIRVV |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)