AT5G23320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homolog of yeast STE14 A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a prenylcysteine alpha-carboxyl methyltransferase involved in methylation of isoprenylated proteins. This protein appears to have lower catalytic activity and a lower transcript expression level than the other ICMT present in Arabidopsis (At5g08335). Analysis of ICMT RNAi lines suggests that this protein may be involved in flower and stem development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
homolog of yeast STE14 A (STE14A); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (InterPro:IPR007269); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family (TAIR:AT5G08335.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:7853368..7853961 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22526.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 197 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTEIFSDTSI RQLSQMLLSL IFFHISEYIL AITIHGASNV TLSSLLITKH YALAMLLSLL EYLTEIILFP GLKQHWWVSN FGLIMIIVGE IIRKAAIITA 101: GRSFTHLIKI NYEEHHGLVT HGVYRLMRHP SYCGFLIWSV GTQVMLCNPV SAVAFAVVVW RFFAQRIPYE EYFLNQFFGV QYLEYAESVA SGVPFVN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)