AT5G06170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.892 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sucrose-proton symporter 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
sucrose symporter with hight affinity for sucrose (K0.5=0.066 +/- 0.025mM), that can also transport a wide range of glucosides. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sucrose-proton symporter 9 (SUC9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sucrose/H+ symporter, plant (InterPro:IPR005989), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sucrose-proton symporter 7 (TAIR:AT1G66570.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:1869791..1871719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52581.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 491 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSDIQAKEDA APVDRQSSSS VVVPDEPSPL RKMISVASIA AGIQFGWALQ LSLLTPYVQL LGVPHKWSSF IWLCGPISGL LVQPTVGYFS DRCKSRFGRR 101: RPFIATGALL VALAVILIGF AADFGHTMGD KLDEAVKIRA VGFFVVGFWI LDVANNTLQG PCRAFLGDLA AGDAKKTRTA NAIFSFFMAV GNVLGYAAGS 201: YTNLHKIFPF TVTKACDIYC ANLKSCFIIS ITLLIVLTII ALWYVEDKQW SPNADSDNEK TPFFGEIFGA FKVMKRPMWM LLAVTALNWI AWFPFLLYDT 301: DWMGREVYGG DSAGDDKMKK LYNHGIQVGS LGLMLNSIVL GVMSLVIGVI SKKIGAKRLW GAVNIILAVC LAMTVLVTKK AEEHRKIAGR MALPTNAIRD 401: GALSLFAILG IPLAITFSIP FALASIISSS SGAGQGLSLG VLNMAIVIPQ MIVSFGVGPI DALFGGGNLP GFVVGAIAAL ISSVVALTVL P |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)