AT4G36450.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.985 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mitogen-activated protein kinase 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of MAP Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
mitogen-activated protein kinase 14 (MPK14); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase 7 (TAIR:AT2G18170.1); Has 121047 Blast hits to 119523 proteins in 4401 species: Archae - 94; Bacteria - 11848; Metazoa - 46560; Fungi - 12391; Plants - 29263; Viruses - 489; Other Eukaryotes - 20402 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:17210245..17211413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41978.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 361 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMLVDPPNG IRQEGKHYYT MWQTLFEIDT KYVPIKPIGR GAYGVVCSSI NSETNERVAI KKIHNVFENR IDALRTLREL KLLRHVRHEN VISLKDVMLP 101: THRYSFRDVY LVYELMDSDL NQIIKSSQSL SDDHCKYFLF QLLRGLKYLH SANILHRDLK PGNLLVNANC DLKICDFGLA RTYEQFMTEY VVTRWYRAPE 201: LLLCCDNYGT SIDVWSVGCI FAEILGRKPI FPGTECLNQL KLIINVVGSQ QDWDLQFIDN QKARRFIKSL PFSKGTHFSH IYPHANPLAI DLLQRMLVFD 301: PTKRISVSDA LLHPYMEGLL EPECNPSENV PVSSLEIDEN MEGDMIREMM WEEMLHYLPR A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)