AT4G31950.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.618 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 82, subfamily C, polypeptide 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of CYP82C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 82, subfamily C, polypeptide 3 (CYP82C3); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 82, subfamily C, polypeptide 4 (TAIR:AT4G31940.1); Has 32928 Blast hits to 32766 proteins in 1729 species: Archae - 58; Bacteria - 3784; Metazoa - 11595; Fungi - 6894; Plants - 9333; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1261 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15455163..15457090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57889.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 512 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDTSLFSLFV SILVFVFIAL FKKSKKPKYV KAPAPSGAWP IIGHLHLLGG KEQLLYRTLG KMADHYGPAM SLRLGSSETF VGSSFEVAKD CFTVNDKALA 101: SLMTAAAKHM GYVFWLEMRK IAMIELLSNR RLQMLNNVRV SEISMGVKDL YSLWVKKGGS EPVMVDLKSW LEDMIANMIM RMVAGKRYFG GGGAESSEHT 201: EEARQWRKGI AKFFHLVGIF TVSDAFPKLG WLDLQGHEKE MKQTRRELDV ILERWIENHR QQRKVSGTKH NDSDFVDVML SLAEQGKLSH LQYDANTCIK 301: TTCLALILGG SETSPSTLTW AISLLLNNKD MLKKVQDEID IHVGRDRNVE DSDIKNLVYL QAIIKETLRL YPAAPLLGHR EAMEDCTVAG YNVPCGTRLI 401: VNVWKIQRDP KVYMEPNEFR PERFITGEAK DFDVRGQNFE LMPFGSGRRS CPGPSLAMQM LHLGLARFLH SFEVKTVLDR PVDMSESPGL TITKATPLEV 501: LINPRLKREL FV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)