AT4G26440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 34 (WRKY34); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY DNA-binding protein 2 (TAIR:AT5G56270.1); Has 5766 Blast hits to 3064 proteins in 189 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 5735; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 31 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13357596..13359550 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62170.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 568 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAGIDNKAAV MGEWFDCSTT NHRKRSKAEL GREFSLNYIK NEDSLQTTFQ ESSRGALRER IAARSGFNAP WLNTEDILQS KSLTISSPGL SPATLLESPV 101: FLSNPLLSPT TGKLSSVPSD KAKAELFDDI TTSLAFQTIS GSGLDPTNIA LEPDDSQDYE ERQLGGLGDS MACCAPADDG YNWRKYGQKL VKGSEYPRSY 201: YKCTHPNCEA KKKVERSREG HIIEIIYTGD HIHSKPPPNR RSGIGSSGTG QDMQIDATEY EGFAGTNENI EWTSPVSAEL EYGSHSGSMQ VQNGTHQFGY 301: GDAAADALYR DENEDDRTSH MSVSLTYDGE VEESESKRRK LEAYATETSG STRASREPRV VVQTTSDIDI LDDGYRWRKY GQKVVKGNPN PRSYYKCTAN 401: GCTVTKHVER ASDDFKSVLT TYIGKHTHVV PAARNSSHVG AGSSGTLQGS LATQTHNHNV HYPMPHSRSE GLATANSSLF DFQSHLRHPT GFSVYIGQSE 501: LSDLSMPGLT IGQEKLTSLQ APDIGDPTGL MLQLAAQPKV EPVSPQQGLD LSASSLICRE MLSRLRQI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)