AT4G23550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY family transcription factor | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes WRKY DNA-binding protein 29 (WRKY29). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY29; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY family transcription factor (TAIR:AT4G01250.1); Has 3402 Blast hits to 2953 proteins in 188 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 3386; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:12291831..12293088 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33772.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 304 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDEGDLEAIV RGYSGSGDAF SGESSGTFSP SFCLPMETSS FYEPEMETSG LDELGELYKP FYPFSTQTIL TSSVSLPEDS KPFRDDKKQR SHGCLLSNGS 101: RADHIRISES KSKKSKKNQQ KRVVEQVKEE NLLSDAWAWR KYGQKPIKGS PYPRSYYRCS SSKGCLARKQ VERNPQNPEK FTITYTNEHN HELPTRRNSL 201: AGSTRAKTSQ PKPTLTKKSE KEVVSSPTSN PMIPSADESS VAVQEMSVAE TSTHQAAGAI EGRRLSNGLP SDLMSGSGTF PSFTGDFDEL LNSQEFFSGY 301: LWNY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)