AT3G22480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.981 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : prefoldin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
prefoldin 2 (PDF2); FUNCTIONS IN: unfolded protein binding; INVOLVED IN: protein folding; LOCATED IN: prefoldin complex; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prefoldin beta-like (InterPro:IPR002777), Prefoldin (InterPro:IPR009053); Has 423 Blast hits to 423 proteins in 206 species: Archae - 15; Bacteria - 0; Metazoa - 139; Fungi - 122; Plants - 68; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 79 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:7969080..7969526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16526.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 148 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASKSGSGGL REPPNEQAVL NMYEGKRSEL SQIYSNITDL EMQVSEHSLV INAIQPLDQS RKCFRMIGGV LVERTIKEVL PAVQRNKDGL EEVVRKLYET 101: LEKKKKDLTE FEAKYKIRIT KQEDNKEGGN KKEGNAQGVL VGAASSSQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)