AT3G06360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arabinogalactan protein 27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an arabinogalactan-protein (AGP27). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
arabinogalactan protein 27 (AGP27); Has 143 Blast hits to 114 proteins in 33 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 17; Fungi - 12; Plants - 53; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 51 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:1928976..1929353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12877.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 3.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 125 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSILLTLI TFIFLSSLSL SSPTTNTIPS SQTISPSEEK ISPEIAPLLP SPAVSSTQTI PSSSTLPEPE NDDVSADPDP AFAPSASPPA SSLASLSSQA 101: PGVFIYFVFA AVYCFSLRLL AVSAI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)