AT2G22930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.632 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-Glycosyltransferase superfamily protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: hypocotyl, root, flower; EXPRESSED DURING: petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT4G09500.2); Has 4996 Blast hits to 4962 proteins in 221 species: Archae - 0; Bacteria - 24; Metazoa - 333; Fungi - 12; Plants - 4610; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9759766..9761094 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49627.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 442 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEPTFHAFMF PWFAFGHMIP FLHLANKLAE KGHQITFLLP KKAQKQLEHH NLFPDSIVFH PLTIPHVNGL PAGAETTSDI SISMDNLLSE ALDLTRDQVE 101: AAVRALRPDL IFFDFAHWIP EIAKEHMIKS VSYMIVSATT IAYTFAPGGV LGVPPPGYPS SKVLYRENDA HALATLSIFY KRLYHQITTG FKSCDIIALR 201: TCNEIEGKFC DYISSQYHKK VLLTGPMLPE QDTSKPLEEQ LSHFLSRFPP RSVVFCALGS QIVLEKDQFQ ELCLGMELTG LPFLIAVKPP RGSSTVEEGL 301: PEGFQERVKG RGVVWGGWVQ QPLILDHPSI GCFVNHCGPG TIWECLMTDC QMVLLPFLGD QVLFTRLMTE EFKVSVEVSR EKTGWFSKES LSDAIKSVMD 401: KDSDLGKLVR SNHAKLKETL GSHGLLTGYV DKFVEELQEY LI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)