AT2G21330.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : fructose-bisphosphate aldolase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
fructose-bisphosphate aldolase 1 (FBA1); FUNCTIONS IN: fructose-bisphosphate aldolase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion, pentose-phosphate shunt; LOCATED IN: in 8 components; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Fructose-bisphosphate aldolase, class-I (InterPro:IPR000741); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fructose-bisphosphate aldolase 2 (TAIR:AT4G38970.1); Has 4798 Blast hits to 4794 proteins in 909 species: Archae - 0; Bacteria - 735; Metazoa - 1150; Fungi - 8; Plants - 476; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2429 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:9128416..9130152 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42933.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 399 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSTATMLK ASPVKSDWVK GQSLLLRQPS SVSAIRSHVA PSALTVRAAS AYADELVKTA KTIASPGHGI MAMDESNATC GKRLASIGLE NTEANRQAYR 101: TLLVSAPGLG QYISGAILFE ETLYQSTTDG KKMVDVLVEQ NIVPGIKVDK GLVPLVGSYD ESWCQGLDGL ASRTAAYYQQ GARFAKWRTV VSIPNGPSAL 201: AVKEAAWGLA RYAAISQDSG LVPIVEPEIM LDGEHGIDRT YDVAEKVWAE VFFYLAQNNV MFEGILLKPS MVTPGAEATD RATPEQVASY TLKLLRNRIP 301: PAVPGIMFLS GGQSELEATL NLNAMNQAPN PWHVSFSYAR ALQNTCLKTW GGKEENVKAA QDILLARAKA NSLAQLGKYT GEGESEEAKE GMFVKGYTY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)