AT1G53030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome C oxidase copper chaperone (COX17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a copper chaperone, can functional complements the yeast COX17 null mutant. May play a role in the delivery of copper to mitochondria. Expressed in roots and thus may also play a role in copper transport in the roots. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome C oxidase copper chaperone (COX17); FUNCTIONS IN: copper chaperone activity; INVOLVED IN: copper ion transport; LOCATED IN: mitochondrial intermembrane space; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome c oxidase copper chaperone (InterPro:IPR007745); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome c oxidase 17 (TAIR:AT3G15352.1); Has 264 Blast hits to 264 proteins in 116 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 137; Fungi - 23; Plants - 55; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 49 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:19760224..19760442 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 7938.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 72 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MSGLQAQDSA CSLDKPSKDV VATETKPKKR ICCACPDTKK LRDECIVEHG ESACTKWIEA HILCLRSEGF KV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)