AT1G35540.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : auxin response factor 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
auxin response factor 14 (ARF14); FUNCTIONS IN: sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of transcription; LOCATED IN: nucleus; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aux/IAA-ARF-dimerisation (InterPro:IPR011525), Transcriptional factor B3 (InterPro:IPR003340), AUX/IAA protein (InterPro:IPR003311), Auxin response factor (InterPro:IPR010525); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: auxin response factor 21 (TAIR:AT1G34410.1); Has 2212 Blast hits to 1870 proteins in 70 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 2210; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:+:13108634..13111700 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 68622.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 605 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESGNVVNTQ PELSGIIDGS KSYMYEQLWK LCAGPLCDIP KLGEKVYYFP QGHIELVEAS TREELNELQP ICDFPSKLQC RVIAIQLKVE NNSDETYAEI 101: TLMPDTTQVV IPTQNQNQFR PLVNSFTKVL TASDTSVHGG FSVPKKHAIE CLPPLDMSQP LPTQEILAID LHGNQWRFRH IYRGTAQRHL LTIGWNAFTT 201: SKKLVEGDVI VFVRGETGEL RVGIRRAGHQ QGNIPSSIVS IESMRHGIIA SAKHAFDNQC MFIVVYKPRS SQFIVSYDKF LDVVNNKFNV GSRFTMRFEG 301: DDFSERRSFG TIIGVSDFSP HWKCSEWRSL EVQWDEFASF PRPNQVSPWD IEHLTPWSNV SRSSFLKNKR SREVNEIGSS SSHLLPPTLT QGQEIGQQSM 401: ATPMNISLRY RDITEDAMTP SRLLMSYPVQ PMAKLNYNNV VTPIEENITT NAVASFRLFG VSLATPSVIK DPVEQIGLEI SRLTQEKKFG QSQILRSPTE 501: IQSKQFSSTR TCTKVQMQGV TIGRAVDLSV LNGYDQLILE LEKLFDLKGQ LQARNQWEIA FTNNEEDKML VGEDPWPEFC NMVKKIFIYS KEEVKNLKSR 601: KSLSS |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)