AT1G33430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.494 plasma membrane 0.380 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Galactosyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Galactosyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: pollen exine formation; LOCATED IN: endomembrane system, membrane; EXPRESSED IN: 12 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, 4 leaf senescence stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 31 (InterPro:IPR002659); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Galactosyltransferase family protein (TAIR:AT1G32930.1); Has 1545 Blast hits to 1534 proteins in 98 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 942; Fungi - 2; Plants - 571; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 30 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:12124438..12126052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44734.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 395 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRAKAASGKA IIVLCLASFL AGSLFMSRTL SRSYIPEEED HHLTKHLSKH LEIQKDCDEH KRKLIESKSR DIIGEVSRTH QAVKSLERTM STLEMELAAA 101: RTSDRSSEFW SERSAKNQSR LQKVFAVIGI NTAFSSKKRR DSVRQTWMPT GEKLKKIEKE KGIVVRFVIG HSATPGGVLD KAIDEEDSEH KDFLRLKHIE 201: GYHQLSTKTR LYFSTATAMY DAEFYVKVDD DVHVNLGMLV TTLARYQSRP RIYIGCMKSG PVLSQKGVKY HEPEFWKFGE EGNKYFRHAT GQIYAISKDL 301: ATYISTNQGI LHRYANEDVS LGAWMLGLEV EHVDERSMCC GTPPDCQWKA QAGNVCAASF DWSCSGICKS VDRMARVHRA CAEGDTPLAN FRFFV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)