AT1G23730.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : beta carbonic anhydrase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
beta carbonic anhydrase 3 (BCA3); FUNCTIONS IN: carbonate dehydratase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: carbon utilization; LOCATED IN: cytosol, plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 14 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbonic anhydrase, prokaryotic-like, conserved site (InterPro:IPR015892), Carbonic anhydrase (InterPro:IPR001765); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta carbonic anhydrase 4 (TAIR:AT1G70410.1); Has 5075 Blast hits to 5060 proteins in 1504 species: Archae - 26; Bacteria - 3914; Metazoa - 59; Fungi - 205; Plants - 361; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 510 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:8395965..8398014 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28830.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 258 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTESYEDAI KRLGELLSKK SDLGNVAAAK IKKLTDELEE LDSNKLDAVE RIKSGFLHFK TNNYEKNPTL YNSLAKSQTP KFLVFACADS RVSPSHILNF 101: QLGEAFIVRN IANMVPPYDK TKHSNVGAAL EYPITVLNVE NILVIGHSCC GGIKGLMAIE DNTAPTKTEF IENWIQICAP AKNRIKQDCK DLSFEDQCTN 201: CEKEAVNVSL GNLLSYPFVR ERVVKNKLAI RGAHYDFVKG TFDLWELDFK TTPAFALS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)