AT1G21230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.961 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : wall associated kinase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a wall-associated kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
wall associated kinase 5 (WAK5); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EGF-like calcium-binding (InterPro:IPR001881), EGF-like, type 3 (InterPro:IPR000742), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EGF-like calcium-binding, conserved site (InterPro:IPR018097), EGF-type aspartate/asparagine hydroxylation site (InterPro:IPR000152), EGF calcium-binding (InterPro:IPR013091), EGF-like (InterPro:IPR006210); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cell wall-associated kinase (TAIR:AT1G21250.1); Has 137298 Blast hits to 123121 proteins in 4733 species: Archae - 125; Bacteria - 14072; Metazoa - 61552; Fungi - 9626; Plants - 33595; Viruses - 427; Other Eukaryotes - 17901 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:7429980..7432346 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 82210.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 733 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKVHSLFLMA IFFYLAYTQL VKAQPRDDCQ TRCGDVPIDY PFGISTGCYY PGDDSFNITC EEDKPNVLSN IEVLNFNHSG QLRGLIPRST VCYDQQTNND 101: FESLWFRLDN LSFSPNNKFT LVGCNAWALL STFGIQNYST GCMSLCDTPP PPNSKCNGVG CCRTEVSIPL DSHRIETQPS RFENMTSVEH FNPCSYAFFV 201: EDGMFNFSSL EDLKDLRNVT RFPVLLDWSI GNQTCEQVVG RNICGGNSTC FDSTRGKGYN CKCLQGFDGN PYLSDGCQDI NECTTRIHNC SDTSTCENTL 301: GSFHCQCPSG SDLNTTTMSC IDTPKEEPKY LGWTTVLLGT TIGFLIILLT ISYIQQKMRH RKNTELRQQF FEQNGGGMLI QRLSGAGPSN VDVKIFTEEG 401: MKEATDGYNE SRILGQGGQG TVYKGILQDN SIVAIKKARL GDRSQVEQFI NEVLVLSQIN HRNVVKLLGC CLETEVPLLV YEFISSGTLF DHLHGSMFDS 501: SLTWEHRLRI AIEVAGTLAY LHSYASIPII HRDVKTANIL LDENLTAKVA DFGASRLIPM DQEQLTTMVQ GTLGYLDPEY YNTGLLNEKS DVYSFGVVLM 601: ELLSGEKALC FERPQSSKHL VSYFVSAMKE NRLHEIIDGQ VMNEYNQREI QESARIAVEC TRIMGEERPS MKEVAAELEA LRVKTTKHQW SDQYPKEVEH 701: LLGVQILSTQ GDTSSIGYDS IQNVTRLDIE TGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)