AT4G25980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.948 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Peroxidase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Peroxidase superfamily protein; FUNCTIONS IN: peroxidase activity; INVOLVED IN: response to oxidative stress, oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: shoot apex, embryo, seed; EXPRESSED DURING: E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant peroxidase (InterPro:IPR000823), Peroxidases heam-ligand binding site (InterPro:IPR019793), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peroxidase superfamily protein (TAIR:AT1G77100.1); Has 4310 Blast hits to 4291 proteins in 250 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 3; Fungi - 82; Plants - 4190; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 35 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13189393..13191507 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40418.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 371 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVSIPVLMK RLCLYNSLSL FLFHLFPSPS LALSFSVELN LLKAQMVWAN AKMRLALSLV TVFFGISLAN LEVGFYSNTC PQAESIVKRV VSGAALSDPN 101: LPAILLRLHF HDCFVEGCDG SILVNNGAIS EKNAFGHEGV RGFEIVEAVK AELEAACPGV VSCSDIVALA ARDAISLANG PAYEVPTGRR DGRVSNMSLA 201: KDMPEVSDSI EILKAKFMQK GLNAKDLVLL SAAHTIGTTA CFFMSKRLYD FLPGGQPDPT INPTFLPELT TQCPQNGDIN VRLPIDRFSE RLFDKQILQN 301: IKDGFAVLQT DAGLYEDVTT RQVVDSYLGM LNPFFGPTFE SDFVKAIVKM GKIGVKTGFK GEIRRVCSAF N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)