AT2G46480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.990 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 2 (GAUT2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galacturonosyltransferase 1 (TAIR:AT3G61130.1); Has 1463 Blast hits to 1447 proteins in 223 species: Archae - 0; Bacteria - 480; Metazoa - 145; Fungi - 0; Plants - 824; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 12 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19076405..19078386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62094.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 528 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTDACCLKGN EDKMVPRFGH GTWIGKAFND TPEMLHERSL RQEKRLERAN ELMNDDSLQK LETAAMARSR SVDSAPLGNY TIWKNEYRRG KSFEDMLRLM 101: QDQIIMARVY SGLAKFTNNL ALHQEIETQL MKLAWEEEST DIDQEQRVLD SIRDMGQILA RAHEQLYECK LVTNKLRAML QTVEDELENE QTYITFLTQL 201: ASKALPDAIH CLTMRLNLEY HLLPLPMRNF PRRENLENPK LYHYALFSDN VLAASVVVNS TVMNAQDPSR HVFHLVTDKL NFGAMSMWFL LNPPGEATIH 301: VQRFEDFTWL NSSYSPVLSQ LESAAMKKFY FKTARSESVE SGSENLKYRY PKYMSMLNHL RFYIPRIFPK LEKILFVDDD VVVQKDLTPL WSIDLKGKVN 401: ENFDPKFCGW AYGMNIFDLK EWKKNNITET YHFWQNLNEN RTLWKLGTLP PGLITFYNLT QPLQRKWHLL GLGYDKGIDV KKIERSAVIH YNGHMKPWTE 501: MGISKYQPYW TKYTNFDHPY IFTCRLFE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)