AT2G33230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.940 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : YUCCA 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
YUCCA 7 (YUC7); FUNCTIONS IN: NADP or NADPH binding, oxidoreductase activity, monooxygenase activity, FAD binding, flavin-containing monooxygenase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II (InterPro:IPR000103), FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), Flavin-containing monooxygenase-like (InterPro:IPR020946); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: YUCCA 3 (TAIR:AT1G04610.1); Has 9342 Blast hits to 9320 proteins in 1117 species: Archae - 14; Bacteria - 4686; Metazoa - 781; Fungi - 1476; Plants - 662; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1723 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14080411..14081971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48150.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 431 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MCNNNNTSCV NISSMLQPED IFSRRCIWVN GPVIVGAGPS GLAVAADLKR QEVPFVILER ANCIASLWQN RTYDRLKLHL PKQFCQLPNL PFPEDIPEYP 101: TKYQFIEYLE SYATHFDLRP KFNETVQSAK YDKRFGLWRV QTVLRSELLG YCEFEYICRW LVVATGENAE KVVPEFEGLE DFGGDVLHAG DYKSGERYRG 201: KRVLVVGCGN SGMEVSLDLC NHDASPSMVV RSSVHVLPRE VLGKSTFELS VTMMKWMPVW LVDKTLLVLT RLLLGNTDKY GLKRPEIGPL ELKNTAGKTP 301: VLDIGAISMI KSGKIKIVAG IAKFGPGKVE LVDGRVLQID SVILATGYRS NVPSWLKEND LGEIGIEKNP FPKGWKGKAG LYAVGFTGRG LSGASFDAMS 401: VAHDIANSWK EETKQQIKTV ATRHRRCISH F |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)