AT1G19550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.917 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glutathione S-transferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Glutathione S-transferase family protein; FUNCTIONS IN: glutathione dehydrogenase (ascorbate) activity; EXPRESSED IN: leaf; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutathione S-transferase, C-terminal (InterPro:IPR004046), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: dehydroascorbate reductase (TAIR:AT1G19570.2); Has 503 Blast hits to 503 proteins in 149 species: Archae - 0; Bacteria - 48; Metazoa - 190; Fungi - 2; Plants - 245; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 18 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6767451..6767983 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17062.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 153 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLVVQICSSP SHEMFWDISP QGKVPVLKID DKWVTDSDAT VGILEEKYPD PPLKTPAEFA SVGSNIFEAL ENHLKSHDGP FIAGERVSAV DLSLAPKLYH 101: LQVALGHFKS WSVPESFPHV HNYMKTLFSL DSFEKTKTEE KCVISGWAPK VNP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)