AT1G35440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.794 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cyclin T1;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cyclin T1;1 (CYCT1;1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Transcription regulator cyclin (InterPro:IPR015429), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin (InterPro:IPR006670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cyclin family protein (TAIR:AT5G45190.1); Has 1935 Blast hits to 1935 proteins in 244 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 1012; Fungi - 386; Plants - 395; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 142 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:13035294..13036037 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28539.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 247 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAETKNWYNT REAIEKTSPS RLDGINLKEE TFQRWSYTSF LQELGQRLNN PQKTIATAIV LCQRFFTRQS LTKNDPKTVA IICMFIAGKV EGSPRPAGDV 101: VFVSYRVLFN KEPLRDVFER LKMTVLTGEK LVLSTLECDL EIEHPYKLVM DWVKRSVKTE DGRRLCQAAF NFVNDSLRTS LCLQFGPSQI ASAAIYIGLS 201: MCKMTLPCDG DKAWWREFDV TKRQLWEICD QMLDLYVQDF VVPRHGL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)