AT1G27045.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Homeobox-leucine zipper protein family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Homeobox-leucine zipper protein family; FUNCTIONS IN: sequence-specific DNA binding, transcription regulator activity, DNA binding, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of transcription, DNA-dependent, regulation of transcription; LOCATED IN: nucleus; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Homeobox (InterPro:IPR001356), Homeobox, conserved site (InterPro:IPR017970), Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor (InterPro:IPR000047), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), Leucine zipper, homeobox-associated (InterPro:IPR003106), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homeobox 1 (TAIR:AT3G01470.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:9391893..9392887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26625.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 227 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENSDTDSEV FFWFQNQNQN HSHKFPSSCF PPSSHSAFYG SSSMINTETA TMDEEDVCES YMMREITKKR KLTPIQLRLL EESFEEEKRL EPDRKLWLAE 101: KLGLQPSQVA VWFQNRRARY KTKQLEHDCD SLKASYAKLK TDWDILFVQN QTLKSKVDLL KEKLKMQENL ETQSIERKRL GEEGSSVKSD NTQYSEEEGL 201: ENQYSFPELA VLGFYYDPTL TASNLRL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)