AT3G52820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 22 (PAP22); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, acid phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 12 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Purple acid phosphatase-like, N-terminal (InterPro:IPR008963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 21 (TAIR:AT3G52810.1); Has 2151 Blast hits to 2132 proteins in 447 species: Archae - 3; Bacteria - 778; Metazoa - 239; Fungi - 77; Plants - 761; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 293 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19574236..19576938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49359.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 434 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLFGLFLSF TLLFLCPFIS QADVPELSRQ PPRPIVFVHN DRSKSDPQQV HISLAGKDHM RVTFITEDNK VESVVEYGKQ PGKYDGKATG ECTSYKYFFY 101: KSGKIHHVKI GPLQANTTYY YRCGGNGPEF SFKTPPSTFP VEFAIVGDLG QTEWTAATLS HINSQDYDVF LLPGDLSYAD THQPLWDSFG RLVEPLASKR 201: PWMVTEGNHE IEFFPIIEHT TFKSYNARWL MPHTESFSTS NLYYSFDVAG VHTVMLGSYT DFDCESDQYQ WLQADLAKVD RKTTPWVVVL LHAPWYNTNE 301: AHEGEGESMR EAMESLLFNA RVDVVFSGHV HAYERFKRVY NNKADPCGPI HITIGDGGNR EGLALSFKKP PSPLSEFRES SFGHGRLKVM DGKRAHWSWH 401: RNNDSNSLLA DEVWLDSLST SSSCWPSSRS NDEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)