AT1G08340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.982 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Rho GTPase activating protein with PAK-box/P21-Rho-binding domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Rho GTPase activating protein with PAK-box/P21-Rho-binding domain; FUNCTIONS IN: Rac GTPase activator activity; INVOLVED IN: signal transduction; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: PAK-box/P21-Rho-binding (InterPro:IPR000095), Rho GTPase activation protein (InterPro:IPR008936), RhoGAP (InterPro:IPR000198); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Rho GTPase activating protein with PAK-box/P21-Rho-binding domain (TAIR:AT5G22400.1); Has 26346 Blast hits to 14360 proteins in 544 species: Archae - 23; Bacteria - 479; Metazoa - 13985; Fungi - 2813; Plants - 1188; Viruses - 517; Other Eukaryotes - 7341 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:2631308..2632669 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36831.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 331 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDIGGPTNIR HVAHVTFDRF DGFLGLPSEF EPDVPRKAPS ASATVFGVST ESMQLSYDSR GNCVPVILLL LQSRLYDQGG LQAEGVFRIT GENSEEEFVR 101: EQLNKGIIPD GIDVHCLAGL IKAWFRELPR GVLDPLPSEQ VMQCESDEDF VKVVRLLPQT EASLLNWAIN LMADVIQFEH VNKMNSRNLA LVFAPNMSQM 201: ADPLTALMYA VQVMKLLKSL TEKTVREREA SSSVVDRRCS KEAEDGEKEK DNEEEEEDEE EEEEEEDEDE DEEEEGDGVY IIKEEEASEI IKVVADEHKS 301: GSIKSEFEGS SATDSKGDNG VVQPPICSSN P |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)