AT5G06090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.388 plasma membrane 0.322 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycerol-3-phosphate acyltransferase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with glycerol-3-phosphate acyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glycerol-3-phosphate acyltransferase 7 (GPAT7); FUNCTIONS IN: 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity, acyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycerol-3-phosphate acyltransferase 5 (TAIR:AT3G11430.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:1835106..1836722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56085.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 500 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESSTTTSYS VVSELEGTLL KNPKPFAYFM LVAFEASGLI RFATLLFLWP IIALLDVLGY RNGSLKLMIF VATAGLHESE IESVARAVLP KFFMDDISMD 101: AWRAFGSCDK RVVVTRMPRV MVERFAKDHL SADEVIGTEI VVNRFGYATG LIQETNVDQS VFNSVANLFV DRRPQLGLGR HIISDSPTFL SLCEEQVHAP 201: VPSNYNGHNQ RLHVQPLPVI FHDGRLVKLP TPATALIILL WIPFGIILAM IRIFVGFLLP LWAIPYVSRI FNTRFIVKGK PPAQATTGNP GVLFVCTHRT 301: LMDPVVLSYV LGRSIPAVTY SISRLSEILS PIPTFRLTRI RDVDAEMIKK ELSNGDLVVY PEGTTCREPF LLRFSALFAE LTDNIVPVAM NYRVGFFHAT 401: TARGWKGLDP IFFFMNPRPV YEVTFLNQLE VEATCSSGKS PYDVANYVQR ILAATLGFEC TNFTRKDKYR VLAGNDGTVS YLSFLDQVKK VVTTFKPFLH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)