AT2G43940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
HARMLESS TO OZONE LAYER 3 (HOL3); FUNCTIONS IN: methyltransferase activity, thiopurine S-methyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: male gametophyte, guard cell, pollen tube; EXPRESSED DURING: M germinated pollen stage, seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thiopurine S-methyltransferase (InterPro:IPR008854); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HARMLESS TO OZONE LAYER 1 (TAIR:AT2G43910.1); Has 1908 Blast hits to 1904 proteins in 625 species: Archae - 27; Bacteria - 1474; Metazoa - 21; Fungi - 109; Plants - 87; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 190 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18196091..18197664 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25043.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 226 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENAGKATSL QSSRDLFHRL MSENSSGGWE KSWEAGATPW DLGKPTPVIA HLVETGSLPN GRALVPGCGT GYDVVAMASP DRHVVGLDIS KTAVERSTKK 101: FSTLPNAKYF SFLSEDFFTW EPAEKFDLIF DYTFFCAFEP GVRPLWAQRM EKLLKPGGEL ITLMFPIDER SGGPPYEVSV SEYEKVLIPL GFEAISIVDN 201: ELAVGPRKGM EKLGRWKKSS TFHSTL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)