AT5G55810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.983 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nicotinate/nicotinamide mononucleotide adenyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a bi-functional enzyme that expresses both nicotinamide-nucleotide adenylyltransferase (2.7.7.1) and nicotinate-nucleotide adenylyltransferase (2.7.7.18)activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nicotinate/nicotinamide mononucleotide adenyltransferase (NMNAT); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Probable nicotinate-nucleotide adenylyltransferase (InterPro:IPR005248), Cytidylyltransferase (InterPro:IPR004820); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:22584229..22586239 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26924.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 238 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDVPLPVEKL SYGSNTEDKT CVVLVATGSF NPPTFMHLRM FELARDELRS KGFHVLGGYM SPVNDAYKKK GLLSAEHRLE MCNVSCQSSD FVMVDPWEAS 101: QSNYQRTLTV LSRVKTFLTT NRHVPEESLK VMLLCGSDLL LSFCTPGVWI PEQLRTICKD YGIVCIRREG QDVENMISGD EILNENCANV KIVDNTVPNQ 201: ISSSRLRQCI SRGLSVKYLT EDGVIDYIRQ HQLYTELT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)