AT5G01500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : thylakoid ATP/ADP carrier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an ATP/ADP carrier that is located to the thylakoid membrane involved in providing ATP during thylakoid biogenesis and turnover | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
thylakoid ATP/ADP carrier (TAAC); FUNCTIONS IN: binding, transporter activity, ATP transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: photosystem II repair, transport, photoprotection; LOCATED IN: in 7 components; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial carrier protein (InterPro:IPR002067), Mitochondrial substrate carrier (InterPro:IPR001993), Mitochondrial substrate/solute carrier (InterPro:IPR018108); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Mitochondrial substrate carrier family protein (TAIR:AT3G51870.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:199017..201329 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45092.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 415 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGEEKSLLQF RSFPSLKTSD FALTEEPSWR LENNVSSNRR RGNKRSGGVF TNFASLSVAI RRDRRESTFN GRNGGGGGAF ASVSVVIPKE EDEFAPTSAQ 101: LLKNPIALLS IVPKDAALFF AGAFAGAAAK SVTAPLDRIK LLMQTHGVRA GQQSAKKAIG FIEAITLIGK EEGIKGYWKG NLPQVIRIVP YSAVQLFAYE 201: TYKKLFRGKD GQLSVLGRLG AGACAGMTST LITYPLDVLR LRLAVEPGYR TMSQVALNML REEGVASFYN GLGPSLLSIA PYIAINFCVF DLVKKSLPEK 301: YQQKTQSSLL TAVVAAAIAT GTCYPLDTIR RQMQLKGTPY KSVLDAFSGI IAREGVVGLY RGFVPNALKS MPNSSIKLTT FDIVKKLIAA SEKEIQRIAD 401: DNRKKASPNT IDEQT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)