AT1G24100.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.782 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 74B1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a UDP-glucose:thiohydroximate S-glucosyltransferase, involved in glucosinolate biosynthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 74B1 (UGT74B1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glycosyltransferase 74 F1 (TAIR:AT2G43840.1); Has 7754 Blast hits to 7677 proteins in 493 species: Archae - 0; Bacteria - 488; Metazoa - 2030; Fungi - 39; Plants - 5027; Viruses - 105; Other Eukaryotes - 65 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:8525547..8527010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51004.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 460 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAETTPKVKG HVVILPYPVQ GHLNPMVQFA KRLVSKNVKV TIATTTYTAS SITTPSLSVE PISDGFDFIP IGIPGFSVDT YSESFKLNGS ETLTLLIEKF 101: KSTDSPIDCL IYDSFLPWGL EVARSMELSA ASFFTNNLTV CSVLRKFSNG DFPLPADPNS APFRIRGLPS LSYDELPSFV GRHWLTHPEH GRVLLNQFPN 201: HENADWLFVN GFEGLEETQD CENGESDAMK ATLIGPMIPS AYLDDRMEDD KDYGASLLKP ISKECMEWLE TKQAQSVAFV SFGSFGILFE KQLAEVAIAL 301: QESDLNFLWV IKEAHIAKLP EGFVESTKDR ALLVSWCNQL EVLAHESIGC FLTHCGWNST LEGLSLGVPM VGVPQWSDQM NDAKFVEEVW KVGYRAKEEA 401: GEVIVKSEEL VRCLKGVMEG ESSVKIRESS KKWKDLAVKA MSEGGSSDRS INEFIESLGK |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)