AT4G30210.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.981 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : P450 reductase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes NADPH-cytochrome P450 reductase that catalyzes the first oxidative step of the phenylpropanoid general pathway. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
P450 reductase 2 (ATR2); FUNCTIONS IN: NADPH-hemoprotein reductase activity; INVOLVED IN: phenylpropanoid metabolic process; LOCATED IN: endoplasmic reticulum, chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ferredoxin reductase-type FAD-binding domain (InterPro:IPR017927), Flavodoxin/nitric oxide synthase (InterPro:IPR008254), Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding (InterPro:IPR001433), Riboflavin synthase-like beta-barrel (InterPro:IPR017938), FAD-binding, type 1 (InterPro:IPR003097), Flavoprotein pyridine nucleotide cytochrome reductase (InterPro:IPR001709), NADPH Cytochrome P450 Reductase (InterPro:IPR015702); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P450 reductase 1 (TAIR:AT4G24520.1); Has 6728 Blast hits to 6356 proteins in 1574 species: Archae - 5; Bacteria - 3354; Metazoa - 1038; Fungi - 894; Plants - 570; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 867 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:14796900..14800578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 78931.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 711 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSSSSSSTS MIDLMAAIIK GEPVIVSDPA NASAYESVAA ELSSMLIENR QFAMIVTTSI AVLIGCIVML VWRRSGSGNS KRVEPLKPLV IKPREEEIDD 101: GRKKVTIFFG TQTGTAEGFA KALGEEAKAR YEKTRFKIVD LDDYAADDDE YEEKLKKEDV AFFFLATYGD GEPTDNAARF YKWFTEGNDR GEWLKNLKYG 201: VFGLGNRQYE HFNKVAKVVD DILVEQGAQR LVQVGLGDDD QCIEDDFTAW REALWPELDT ILREEGDTAV ATPYTAAVLE YRVSIHDSED AKFNDINMAN 301: GNGYTVFDAQ HPYKANVAVK RELHTPESDR SCIHLEFDIA GSGLTYETGD HVGVLCDNLS ETVDEALRLL DMSPDTYFSL HAEKEDGTPI SSSLPPPFPP 401: CNLRTALTRY ACLLSSPKKS ALVALAAHAS DPTEAERLKH LASPAGKDEY SKWVVESQRS LLEVMAEFPS AKPPLGVFFA GVAPRLQPRF YSISSSPKIA 501: ETRIHVTCAL VYEKMPTGRI HKGVCSTWMK NAVPYEKSEN CSSAPIFVRQ SNFKLPSDSK VPIIMIGPGT GLAPFRGFLQ ERLALVESGV ELGPSVLFFG 601: CRNRRMDFIY EEELQRFVES GALAELSVAF SREGPTKEYV QHKMMDKASD IWNMISQGAY LYVCGDAKGM ARDVHRSLHT IAQEQGSMDS TKAEGFVKNL 701: QTSGRYLRDV W |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)