AT4G11490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cysteine-rich receptor-like protein kinase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 33 (CRK33); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: sperm cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 14 (TAIR:AT4G23220.1); Has 120803 Blast hits to 119313 proteins in 4430 species: Archae - 92; Bacteria - 13915; Metazoa - 44329; Fungi - 10265; Plants - 34279; Viruses - 409; Other Eukaryotes - 17514 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6978848..6981548 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71697.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 636 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRKTKKISFL IFWVVLISII GAISSQQCNE TGYFEPWKTY DTNRRQILTS LASKVVDHYG FYNSSIGKVP DEVHVMGMCI DGTEPTVCSD CLKVAADQLQ 101: ENCPNQTEAY TWTPHKTLCF ARYSNSSFFK RVGLHPLYME HSNVDIKSNL TYLNTIWEAL TDRLMSDASS DYNASLSSRR YYAANVTNLT NFQNIYALML 201: CTPDLEKGAC HNCLEKAVSE YGNLRMQRGI VAWPSCCFRW DLYPFIGAFN LTLSPPPGSK RNISVGFFVA IVVATGVVIS VLSTLVVVLV CRKRKTDPPE 301: ESPKYSLQYD LKTIEAATCT FSKCNMLGQG GFGEVFKGVL QDGSEIAVKR LSKESAQGVQ EFQNETSLVA KLQHRNLVGV LGFCMEGEEK ILVYEFVPNK 401: SLDQFLFEPT KKGQLDWAKR YKIIVGTARG ILYLHHDSPL KIIHRDLKAS NILLDAEMEP KVADFGMARI FRVDQSRADT RRVVGTHGYI SPEYLMHGQF 501: SVKSDVYSFG VLVLEIISGK RNSNFHETDE SGKNLVTYAW RHWRNGSPLE LVDSELEKNY QSNEVFRCIH IALLCVQNDP EQRPNLSTII MMLTSNSITL 601: PVPQSPVYEG MDMFLPSIKS LPGSVNDSLI DDLVPR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)