AT4G10550.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.711 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Subtilase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Subtilase family protein; FUNCTIONS IN: identical protein binding, serine-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, negative regulation of catalytic activity; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease-associated PA (InterPro:IPR003137), Proteinase inhibitor, propeptide (InterPro:IPR009020), Peptidase S8/S53, subtilisin/kexin/sedolisin (InterPro:IPR000209), Proteinase inhibitor I9, subtilisin propeptide (InterPro:IPR010259), Peptidase S8/S53, subtilisin, active site (InterPro:IPR022398), Peptidase S8, subtilisin-related (InterPro:IPR015500); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Subtilase family protein (TAIR:AT4G10540.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:6516613..6520272 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85305.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 794 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLRLQNPIS PALKFTGHLP PSKALKSSKE TIFLTKERSF VAESSAKRKV HIVYLGEKQH DDPEFVTESH HRMLWSLLGS KEDANDSMVY SYRHGFSGFA 101: AKLTESQAKK IADLPDVVHV IPDSFYKLAT TRTWDYLGLS AANPKSLLHE TNMGEQIIIG VIDTGVWPES EVFNDSGFGP VPSHWKGGCE TGENFNSSNC 201: NKKLIGAKYF INGFLAENES FNSTNSLDFI SPRDLDGHGT HVSTIAGGSF VPNISYKGLA GGTVRGGAPR AHIAMYKACW YLDDDDTTTC SSADILKAMD 301: EAMHDGVDVL SISLGSSVPL YGETDIRDGI TTGAFHAVLK GITVVCSGGN SGPDSLTVTN TAPWIITVAA TTLDRSFATP LTLGNNKVIL GQAMYTGPGL 401: GFTSLVYPEN PGNSNESFSG TCEELLFNSN RTMEGKVVLC FTTSPYGGAV LSAARYVKRA GGLGVIIARH PGYAIQPCLD DFPCVAVDWE LGTDILLYTR 501: SSGSPVVKIQ PSKTLVGQPV GTKVATFSSR GPNSIAPAIL KPDIAAPGVS ILAATTNTTF SDQGFIMLSG TSMAAPAISG VAALLKALHR DWSPAAIRSA 601: IVTTAWKTDP FGEQIFAEGS PPKLADPFDY GGGLVNPEKS ANPGLVYDMG LEDYVLYMCS VGYNETSISQ LIGKTTVCSN PKPSVLDFNL PSITIPNLKD 701: EVTITRTVTN VGPLNSVYRV TVEPPLGFQV TVTPETLVFN STTKKVYFKV KVSTTHKTNT GYYFGSLTWS DSLHNVTIPL SVRTQILQNY YDEN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)