AT3G05230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Signal peptidase subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Signal peptidase subunit; FUNCTIONS IN: peptidase activity; INVOLVED IN: signal peptide processing; LOCATED IN: endoplasmic reticulum, cell wall; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Signal peptidase 22kDa subunit (InterPro:IPR007653); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Signal peptidase subunit (TAIR:AT5G27430.1); Has 426 Blast hits to 426 proteins in 201 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 140; Fungi - 138; Plants - 78; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 70 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:1492304..1493452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19019.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 167 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MHTFGYRANA LLTFAVTALA FICAIASFSD KFSNQNPSAE IQILNINRFK KQSHGNDEVS LTLDISADLQ SLFTWNTKQV FVFVAAEYET PKNSLNQVSL 101: WDAIIPAKEH AKFRIQVSNK YRFIDQGQNL RGKDFNLTLH WHVMPKTGKM FADKIVLPGY SLPDAYR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)