AT2G19690.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phospholipase A2-beta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of four PLA2 genes in Arabidopsis. Involved in stomatal opening in response to light. Expressed in guard cells. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
phospholipase A2-beta (PLA2-BETA); FUNCTIONS IN: phospholipase A2 activity, calcium ion binding; INVOLVED IN: response to light stimulus, regulation of stomatal movement; LOCATED IN: endoplasmic reticulum; EXPRESSED IN: vascular tissue, leaf mesophyll, guard cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipase A2, active site (InterPro:IPR013090), Phospholipase A2 (InterPro:IPR016090), Phospholipase A2, eukaryotic (InterPro:IPR001211); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phospholipase A2 family protein (TAIR:AT4G29460.1); Has 389 Blast hits to 389 proteins in 80 species: Archae - 0; Bacteria - 29; Metazoa - 247; Fungi - 0; Plants - 108; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8503326..8504549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16287.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 147 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMFRTSLMRF AAAFFAIVFV VLVGVARSEE CTRTCIAQNC DTLSIRYGKY CGIGHSGCPG EEPCDDLDAC CKIHDHCVEL NGMTNISCHK KFQRCVNRLS 101: KAIKQSKNKK VGFSTKCPYS VVIPTVNQGM DIGILFSQLG NDMKTEL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)