AT2G07718.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cytochrome b/b6 protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cytochrome b/b6 protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity; INVOLVED IN: respiratory electron transport chain; LOCATED IN: membrane; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome b/b6 (InterPro:IPR016175); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome b/b6 protein (TAIR:ATMG00590.1); Has 30524 Blast hits to 30523 proteins in 4798 species: Archae - 0; Bacteria - 37; Metazoa - 29076; Fungi - 2; Plants - 664; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 745 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:3426263..3427204 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35539.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 313 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTIRNQRFSL LKQPISSTLN QHLVDYPTPS NLSYWWGFGP LAGTMILSVL SSPALVSGLM VARAKNLVHS VLFPIPIFFS INQLFHYFCR LPIIKHLATK 101: CQLLLFLISH FLLLLVLTKL VLDLGGYLFM DDLSRALSQF VPGFSGGLGG GSNTPPNPSG DFFLSSYQTS DPDYHDQRRG DSYFSSAPGV QETHRHASGS 201: STNLHLNLND QSQDPIFLEV ERLSLKCDKV KEKTILKTQS LLLERGYHIP DERDIERAIN VVMTEHETID IDRRRKRFYY LYSCLGKTGN KFWMELLETL 301: ADYNINIKSD SDN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)