AT1G69750.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome c oxidase 19-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome c oxidase 19-2 (COX19-2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CHCH (InterPro:IPR010625); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome c oxidase 19-1 (TAIR:AT1G66590.1); Has 290 Blast hits to 290 proteins in 159 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 77; Fungi - 106; Plants - 52; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 55 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:26236352..26237316 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 10936.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 98 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MSTGGAFGGN RGLRPIPPEK GIFPLDHLHE CDAEKKEYLG CLKSSAHKSE QCRHLSKKYL QCRMAKNLMA KQDMAELGFS GVKELDSTED KNTESIEH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)