AT1G67940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : non-intrinsic ABC protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of NAP subfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
non-intrinsic ABC protein 3 (NAP3); FUNCTIONS IN: transporter activity; INVOLVED IN: phosphate transport; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphate transport system permease protein 1 (InterPro:IPR005670), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ABC transporter-like (InterPro:IPR003439), ABC transporter, conserved site (InterPro:IPR017871); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P-glycoprotein 7 (TAIR:AT5G46540.1); Has 422748 Blast hits to 381356 proteins in 3991 species: Archae - 7530; Bacteria - 326504; Metazoa - 9961; Fungi - 7250; Plants - 4967; Viruses - 18; Other Eukaryotes - 66518 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:25477805..25478667 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28678.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 263 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPSLWSNESD GSLREHLVDV VVSGSEPKIR VHDLTRVADD GSRILKGVTI DIPKGMIVGV IGPSGSGKST FLRSLNRLWE PPESTVFLDG EDITNVDVIA 101: LRRRVGMLFQ LPVLFQGTVA DNVRYGPNLR GEKLSDEEVY KLLSLADLDA SFAKKTGAEL SVGQAQRVAL ARTLANEPEV LLLDEPTSAL DPISTENIED 201: VIVKLKKQRG ITTVIVSHSI KQIQKVADIV CLVVDGEIVE VLKPSELSHA THPMAQRFLQ LSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)