AT1G63270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : non-intrinsic ABC protein 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of a heterogenous group of non-intrinsic ATP-binding cassette (ABC) proteins. Members of this group bear no close resemblance to each other nor to representatives of specific ABC protein subfamilies from other organisms. This grouping is arbitrary and will likely change upon acquisition of further data. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
non-intrinsic ABC protein 10 (NAP10); FUNCTIONS IN: transporter activity; INVOLVED IN: transport; EXPRESSED IN: cotyledon; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), ABC transporter-like (InterPro:IPR003439), ABC transporter, haem export, CcmA (InterPro:IPR005895); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: non-intrinsic ABC protein 3 (TAIR:AT1G67940.1); Has 360446 Blast hits to 338127 proteins in 3858 species: Archae - 6408; Bacteria - 294085; Metazoa - 7445; Fungi - 3734; Plants - 4292; Viruses - 13; Other Eukaryotes - 44469 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23469664..23470353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25977.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 229 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSIRRPQIPR LLLQNVSCMR NAQQILRHVN VSLHDGGALV LTGTNGSGKS TFLRMLAGFS KPSAGEILWN GHDITQSGIF QQYKLQLNWI SLKDAIKERF 101: TVLDNVQWFE LLENKIGKAQ PALELMGLGR LVKEKSRMLS MGQRKRLQLA RLLAIDRPIW LLDEPSVALD DEGVRLLEYI IAEHRKKGGI VIVATHLPID 201: IEDAMILRLP PRFPRKMTLI DMLDRADIS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)