AT1G48020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pectin methylesterase inhibitor 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Pectin methylesterase inhibitor AtPMEI1. Inactivates AtPPME1 in vitro. Localized to pollen tube cell tip. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pectin methylesterase inhibitor 1 (PMEI1); FUNCTIONS IN: pectinesterase inhibitor activity; INVOLVED IN: pollen tube growth; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: pollen tube tip; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pectinesterase inhibitor (InterPro:IPR006501); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: pectin methylesterase inhibitor 2 (TAIR:AT3G17220.1); Has 263 Blast hits to 260 proteins in 21 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 263; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:17716234..17716764 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18967.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 176 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAANLRNNAF LSSLMFLLLI GSSYAITSSE MSTICDKTLN PSFCLKFLNT KFASPNLQAL AKTTLDSTQA RATQTLKKLQ SIIDGGVDPR SKLAYRSCVD 101: EYESAIGNLE EAFEHLASGD GMGMNMKVSA ALDGADTCLD DVKRLRSVDS SVVNNSKTIK NLCGIALVIS NMLPRN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)