AT1G20575.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 2 (InterPro:IPR001173); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein (TAIR:AT2G39630.1); Has 22705 Blast hits to 22656 proteins in 2589 species: Archae - 933; Bacteria - 16103; Metazoa - 288; Fungi - 260; Plants - 98; Viruses - 23; Other Eukaryotes - 5000 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:7126987..7128677 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27677.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 246 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADEMETKGE KKYKYSIIIP TYNERLNIAI IVYLIFKHLR DVDFEIIVVD DGSPDGTQEI VKQLQQLYGE DRILLRARAK KLGLGTAYIH GLKHATGDFV 101: VIMDADLSHH PKYLPSFIKK QLETNASIVT GTRYVKGGGV HGWNLMRKLT SRGANVLAQT LLWPGVSDLT GSFRLYKKSA LEDVISSCVS KGYVFQMEMI 201: VRATRKGYHI EEVPITFVDR VFGTSKLGGS EIVEYLKGLV YLLLTT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)