AT2G35020.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein that functions as an N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase that catalyzes the formation of UDP-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc). This is an essential precursor for glycolipid and glycoprotein synthesis and is also used for regulatory protein modification in signaling pathways. The enzyme can also catalyze the reverse reaction using both UDP-GlcNAc and the less common UDP-N-acetylgalactosamine as substrates. This enzyme can also act on glucose-1-phosphate to produce UDP-glucose. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase 2 (GlcNAc1pUT2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase (InterPro:IPR002618); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase 1 (TAIR:AT1G31070.2); Has 1547 Blast hits to 1541 proteins in 446 species: Archae - 0; Bacteria - 380; Metazoa - 421; Fungi - 279; Plants - 232; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 235 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:+:14756803..14760477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 55762.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 5.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 502 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKEPTTEIEI ETSAVATILP PPLPPTASPH QALVERLKDY GQEDVFSLWD ELSPEERDLL LRDIENLDLP RIDRIIRCSL HSQGLPVAAI EPVPENCVST 101: VEERTKEDRE KWWKMGLKAI YEGKLGVVLL SGGQGTRLGS SDPKGCYNIG LPSGKSLFQI QAERILCVQR LASQAMSEAS PTRPVTIQWY IMTSPFTHEP 201: TQKFFKSHKY FGLEPDQVTF FQQGTLPCIS KDGKFIMETP FSLSKAPDGN GGVYTALKSS RLLEDMASRG IKYVDCYGVD NVLVRVADPT FLGYFIDKSA 301: ASAAKVVRKA YPQEKVGVFV RRGKGGPLTV VEYTELDQSM ASATNQQTGR LQYCWSNVCL HMFTLDFLNQ VANGLEKDSV YHLAEKKIPS INGDIVGLKL 401: EQFIFDCFPY APSTALFEVL REEEFAPVKN ANGSNYDTPE SARLLVLRLH TRWVIAAGGF LTHSVPLYAT GVEVSPLCSY AGENLEAICR GRTFHAPCEI 501: SL |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)