AT5G19470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nudix hydrolase homolog 24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nudix hydrolase homolog 24 (NUDT24); FUNCTIONS IN: hydrolase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: vascular tissue, male gametophyte; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NUDIX hydrolase domain-like (InterPro:IPR015797), NUDIX hydrolase domain (InterPro:IPR000086); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nudix hydrolase homolog 20 (TAIR:AT5G19460.1); Has 735 Blast hits to 734 proteins in 306 species: Archae - 0; Bacteria - 325; Metazoa - 73; Fungi - 189; Plants - 55; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 93 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:6566357..6568632 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41058.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 365 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASAFCSLCP TPTSLFSSHA LIPTLQWRSS SSSRSPPLHI SRVLSVETVP LSPSFTWNDV FENSRKEYVP QNSSDLTGFL EKVDRCNRGL EKLGEFIPFV 101: IEEQIVGYIH KGFTKYLRDF NDIFTFSQYG GHVTLNMMLD KPEERTRAVA HVIKILGNKG IIPGIRNELY PVKPSFNAPA FFSIERAAAP YFGLKGYAIH 201: VNGYVERDGQ KFLWIGKRSL AKSTYPGKLD HLVAGGLPHG ISVCENLVKE CEEEAGISKV LADRAIAVGV VSYMDIDRYC FTRDVLFCYD LELPQDFVPT 301: NQDGEVDSFR LIPVAQVANV VRKTSFFKDS CSLVIIDFLF RHGLIRPESP GYLDLYRRLR NGDCS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)