AT4G31970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.804 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 82, subfamily C, polypeptide 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of CYP82C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 82, subfamily C, polypeptide 2 (CYP82C2); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 82, subfamily C, polypeptide 4 (TAIR:AT4G31940.1); Has 33251 Blast hits to 33030 proteins in 1722 species: Archae - 60; Bacteria - 4009; Metazoa - 11748; Fungi - 6717; Plants - 9506; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1208 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15462408..15464358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59005.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 523 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDTSLFSLFV PILVFVFIAL FKKSKKPKHV KAPAPSGAWP IIGHLHLLSG KEQLLYRTLG KMADQYGPAM SLRLGSSETF VVSSFEVAKD CFTVNDKALA 101: SRPITAAAKH MGYDCAVFGF APYSAFWREM RKIATLELLS NRRLQMLKHV RVSEISMVMQ DLYSLWVKKG GSEPVMVDLK SWLEDMSLNM MVRMVAGKRY 201: FGGGSLSPED AEEARQCRKG VANFFHLVGI FTVSDAFPKL GWFDFQGHEK EMKQTGRELD VILERWIENH RQQRKVSGTK HNDSDFVDVM LSLAEQGKFS 301: HLQHDAITSI KSTCLALILG GSETSPSTLT WAISLLLNNK DMLKKAQDEI DIHVGRDRNV EDSDIENLVY IQAIIKETLR LYPAGPLLGH REAIEDCTVA 401: GYNVRRGTRM LVNVWKIQRD PRVYMEPNEF RPERFITGEA KEFDVRGQNF ELMPFGSGRR SCPGSSLAMQ VLHLGLARFL QSFDVKTVMD MPVDMTESPG 501: LTIPKATPLE ILISPRLKEG LYV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)