AT4G18440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : L-Aspartase-like family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
L-Aspartase-like family protein; FUNCTIONS IN: N6-(1,2-dicarboxyethyl)AMP AMP-lyase (fumarate-forming) activity, catalytic activity; INVOLVED IN: purine ribonucleotide biosynthetic process, purine base biosynthetic process, IMP biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast stroma; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenylosuccinate lyase C-terminal/plant (InterPro:IPR013539), L-Aspartase-like (InterPro:IPR008948), Adenylosuccinate lyase (InterPro:IPR004769), Fumarate lyase, conserved site (InterPro:IPR020557), Lyase 1, N-terminal (InterPro:IPR022761), Fumarate lyase (InterPro:IPR000362); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: L-Aspartase-like family protein (TAIR:AT1G36280.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:10186385..10188832 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59760.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 536 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELNFSSMAI THPKIPSFGF TPTGIFLNPS KSVCLASHHR LPRVSCSVST TTDSPKLVTS TKVTAMDGVS SRDLEMSNLT ALSPLDGRYW SKVKDLASSL 101: SEFGLIYFRV FVEIKWLLKL SNIPEVTEVP SFSKEAQSFL QGIIDGFSID DALEIKKIER VTNHDVKAVE YFLKQKCESQ PEIAKVLEFF HFACTSEDIN 201: NLSHALMLQE ALSSVILPTM DELIKSISLI AKNFAYVPML SRTHGQPATP TTLGKEMANF AVRLSEERRY LSETKIKGKF AGAVGNYNAH ISAYSNIDWP 301: HVSEEFVTSL GLTFNPYVTQ IEPHDYMARL FNNISQFNTI LIDFDRDIWS YISLGYFKQT TKAGEIGSST MPHKVNPIDF ENSEGNLGKA NAELTFLSMK 401: LPISRMQRDL TDSTVLRNMG GALGHSLLAY KSAIQGIGKL QVNEARLKED LDDNWEVLAE PIQTVMRRYG VPEPYEKLKE LTRGKAVNEE TIRTFIKGLE 501: LPSEAKDQLL ELTPHTYVGA AAALALAVDE ALHLGH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)