AT4G16710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.650 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycosyltransferase family protein 28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
glycosyltransferase family protein 28; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, carbohydrate binding, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: lipid glycosylation, biosynthetic process, carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 28, C-terminal (InterPro:IPR007235); Has 641 Blast hits to 636 proteins in 314 species: Archae - 10; Bacteria - 242; Metazoa - 125; Fungi - 122; Plants - 50; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 92 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:9398818..9399618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19583.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 176 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEEDRENAKR VVFVTVGTTS FDALVKAVVS QNVKDELQKR GFTHLLIQMG RGIFFPTKCD GADGSLVVDY FTFSSSIADY IRSASLVISH AGSGSIFETL 101: KLGKPLIVVV NEDLMDNHQC ELAEALEERK HLYYTRPHSL HQTLTKMELG SLVQYTPGDG TPVARIIDRF LGFPDD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)