AT4G11310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Papain family cysteine protease | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
cysteine proteinase precursor-like protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Papain family cysteine protease; FUNCTIONS IN: cysteine-type peptidase activity, cysteine-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: cell wall; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase C1A, papain (InterPro:IPR013128), Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide (InterPro:IPR013201), Peptidase C1A, papain C-terminal (InterPro:IPR000668), Peptidase, cysteine peptidase active site (InterPro:IPR000169); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Papain family cysteine protease (TAIR:AT4G11320.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6883594..6885318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39927.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 364 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSAKSAMLI LLVAMVIASC ATAIDMSVVS YDDNNRLHSV FDAEASLIFE SWMVKHGKVY GSVAEKERRL TIFEDNLRFI NNRNAENLSY RLGLTGFADL 101: SLHEYKEVCH GADPRPPRNH VFMTSSDRYK TSADDVLPKS VDWRNEGAVT EVKDQGHCRS CWAFSTVGAV EGLNKIVTGE LVTLSEQDLI NCNKENNGCG 201: GGKLETAYEF IMKNGGLGTD NDYPYKAVNG VCDGRLKENN KNVMIDGYEN LPANDESALM KAVAHQPVTA VIDSSSREFQ LYESGVFDGS CGTNLNHGVV 301: VVGYGTENGR DYWLVKNSRG ITWGEAGYMK MARNIANPRG LCGIAMRASY PLKNSFSTDK SSIA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)