AT4G11060.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : mitochondrially targeted single-stranded DNA binding protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
mitochondrially targeted single-stranded DNA binding protein (MTSSB); FUNCTIONS IN: single-stranded DNA binding; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleic acid-binding, OB-fold (InterPro:IPR012340), Nucleic acid-binding, OB-fold-like (InterPro:IPR016027), Primosome PriB/single-strand DNA-binding (InterPro:IPR000424); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein (TAIR:AT3G18580.1); Has 3842 Blast hits to 3842 proteins in 1060 species: Archae - 0; Bacteria - 2446; Metazoa - 112; Fungi - 0; Plants - 68; Viruses - 25; Other Eukaryotes - 1191 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:6754820..6756230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22238.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 201 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNSLAIRVSK VLRSSSISPL AISAERGSKS WFSTGPIDEG VEEDFEENVT ERPELQPHGV DPRKGWGFRG VHRAIICGKV GQAPLQKILR NGRTVTIFTV 101: GTGGMFDQRL VGATNQPKPA QWHRIAVHNE VLGSYAVQKL AKNSSVYVEG DIETRVYNDS ISSEVKSIPE ICVRRDGKIR MIKYGESISK ISFDELKEGL 201: I |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)