AT3G52010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine carboxypeptidase-like 37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
serine carboxypeptidase-like 37 (scpl37); FUNCTIONS IN: serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563), Peptidase S10, serine carboxypeptidase, active site (InterPro:IPR018202); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 36 (TAIR:AT3G52000.1); Has 3598 Blast hits to 3523 proteins in 345 species: Archae - 0; Bacteria - 164; Metazoa - 649; Fungi - 870; Plants - 1470; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 445 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19296244..19297928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54917.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 487 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVKQQDWSVT TCVLLFLFLA SQIHCRSGIH VSKRLEGSKQ GDGKSGDTSF NVLRRVLSPK EKDLIKKLPG QPSGVSFRQY GGYVPVNEPS SRFLYYYFVE 101: AIKPNTSTPL VIWFNGGPAC SSLGGAFLEL GPFRVHSGGR KLFRNPYSWN NEANVLFLES PVTTGFSYSS NPIDLEELGE KGDKATAEDN YIFLMNWLER 201: FPEYKGRDIY IAGQSYAGHY VPQLAQIIIH RNKKTLVNLR GILIGNPSLL TSIQDPYGYE FMLSHGLMSQ QQMDNYNQFC LRDDLYDNDK CALSVKTIDD 301: AKKHLDTYNI YAPVCLNSTL SRISKKCTTV LEVDPCSKDY LKAYLNRKKV QKAIHANTTK LPYEWTSCNN ELTENWSEND RDTPMIPILH ELMGEGVRVM 401: IYNGDVDLEI PFASTLAVVK EMNLTVVKEF RPWFTGGQLG GFTEDYKGNL TFVTVKGAGH SVPTDQPIHA LNIFTSFIRN TPLPHTA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)