AT2G01270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.897 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : quiescin-sulfhydryl oxidase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein disulfide isomerase-like (PDIL) protein, a member of a multigene family within the thioredoxin (TRX) superfamily. This protein also belongs to the quiescin-sulfhydryl oxidase (QSOX) family, which possess an Erv1-like domain at the COOH terminus in addition to a TRX domain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
quiescin-sulfhydryl oxidase 2 (QSOX2); FUNCTIONS IN: thiol oxidase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, cell redox homeostasis; LOCATED IN: Golgi apparatus; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Erv1/Alr (InterPro:IPR006863), Thioredoxin domain (InterPro:IPR013766), Thioredoxin, conserved site (InterPro:IPR017937), ERV/ALR sulphydryl oxidase (InterPro:IPR017905), Thioredoxin-like (InterPro:IPR017936), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: quiescin-sulfhydryl oxidase 1 (TAIR:AT1G15020.1); Has 2833 Blast hits to 2194 proteins in 312 species: Archae - 22; Bacteria - 32; Metazoa - 1533; Fungi - 396; Plants - 476; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 374 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:139457..142141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55921.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 495 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLVHLLLFA GLVIAASSSS PGSRLILREI SDQKDKAVEL NTTNFDSVLK DTPAKYAVVE FFAHWCPACR NYKPHYEKVA RLFNGPDAIH PGIVLMTRVD 101: CAMKTNTKLC DKFSVSHYPM LFWGPPTKFV SGSWEPKKDK SEILVIDDGR TAERLLNWIN KQIGSSYGLD DQKFKNEHAL SNLTDYNQIS QAVYDVEEAT 201: AEAFDIILAH KAIKSSETSA SFIRFIQLLA AHHLSRRCRK GAAEILVNYD DLCPSGNCSY EKSGGNDTLG NFPICGKDVP RGYYMFCRGS KNDTRGFSCG 301: LWVLMHSLSV RIEDGESHFA FTTICDFVNN FFMCDECRLH FNDMCLSVKT PFKKARDFVL WVWSTHNKVN ERLLKDEASL GTGDPKFPKI IWPPKELCPL 401: CYLSSNQKSI EWDHEHVYKF LKNYYGPKLV SLYKEKSVSR SKEETVSATE DLTVATNALV VPIGAALAIA IASCAFGALA CYWRTQQKNR KPRRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)